التشخيص الجزيئي وتحديد الجينوم الكامل ولأول مرة في العراق للفطرFusarium solani FSSC5

تمكن فريق بحثي مؤلف من طالبة الماجستير صفا جميل شيحان و أ.د. رجاء غازي عبد المحسن وأ.م.د. عدنان عبد الجليل لهوف في قسم وقاية النبات، كلية الزراعة ، جامعة كربلاء من التشخيص وتحديد الجينوم الكامل ولأول مرة في العراق للفطر Fusarium solani FSSC5 الذي يصيب نبات الزينة المعروف باسم عرف الديك (Celosia argentea) في العديد من مشاتل محافظتي كربلاء وبابل مسبباً لها مرض عفن الجذور التاجي كما وجد ان له مدى عائلي واسع من خلال تسببه بنفس المرض للعديد من العوائل النباتية المهمة اقتصادياً. بعد دراسة خصائص الفطر الحيوية والامراضية والمظهرية تم تشخيصه جزئياً باستعمال ستة واسمات جينية مهمة في تشخيص الفطريات شملت internal transcribed spacer (ITS) و translation elongation factor (TEF-1α) و RNA polymerase II (RPB 1) و RNA polymerase II (RPB 2) و beta-tubulin 1 (β-tubulin) بالإضافة الى mitochondrial small-subunit ribosomal RNA . ولغرض تحديد انتساب الفطر F. solani المعزول في هذه الدراسة الى أي من الأعضاء الستين التابعة الى Fusarium solani species complex (FSSC) التي تُعد مراتب تصنيفية تحت النوع تم تحديد وتفسير الجينوم الكامل له بواسطة تقنية تسلسل الجيل التالي (Next Generation Sequencing). أذ تبين انه يتكون من 51,743,296 قاعدة نايتروجينية وكان عدد الجينات المشفرة للبروتينات هي 17,940 جين تشفر لـ 17,654 بروتين وانه يعود الى العضو الخامس (FSSC5) وقد تم إيداع تسلسل الجينوم الكامل للفطر ضمن قاعدة بيانات الجينومات التابعة للمركز الوطني لمعلومات التقانة الحيوية NCBI-genome تحت الرمز JAMJFY000000000.1